Re: [InetBib] Wissenschaftliche Ver�ffentlichung zu LIVIVO

[Müller, Bernd via InetBib <inetbib@xxxxxxxxxx>]

Lieber Herr Lohmeier,

Vielen Dank für Ihr Interesse zu dem Artikel und den technischen Details zur 
Architektur des "ZB MED Knowledge Environments".

Das ZB MED KE ist nicht nur als Metadaten-Aggregation für die ZB 
MED-Informationsdienste und LIVIVO konstruiert, sondern als Pool von 
heterogenen NoSQL-Datenbanken mit Metadaten, Volltexten und Annotationen aus 
lebenswissenschaftlichen Ontologien, die auch von der Forschung verwendet 
werden. Daran gekoppelt sind Komponenten des UIMA-Frameworks, die Konzepte und 
deren Relationen aus der Linked Open Data-Cloud für Text und Data Mining 
verwenden. In dem Artikel zu LIVIVO wird auch an entsprechender Stelle auf die 
Publikation mit Details zur Architektur verwiesen, die ich bei der 
SEMANTiCs'16-Konferenz im September in Leipzig als Poster präsentiert habe: 
http://ceur-ws.org/Vol-1695/paper1.pdf

Die Komponenten des ZB MED KE basieren auf Open Source-Datenbanken (SOLR, 
Neo4j, MongoDB), Open Source-Frameworks (UIMA) und Linked Open Data-Sets (MeSH, 
AGROVOC, DrugBank). Erste Ergebnisse des UIMA-Workflows sind als JSON-LD 
verfügbar unter https://datahub.io/dataset/livtdm

Des Weiteren ist eine Demo zur Visualisierung der Text und Data Mining 
Ergebnisse unter http://labs.livivo.de/ zu erreichen. Es ist geplant, weitere 
Datenaggregationen aus der ZB MED KE als Linked Open Data bereit zu stellen.

Gerne beantworte ich Ihnen weitere aufkommende Fragen.

Gruß,
Bernd Müller

--
Dipl.-Inform. (FH) Bernd Müller, M.Sc. in Life Science Informatics
Leitung Semantisches Retrieval
Text und Data Mining
Programmbereich Angewandte Forschung & Innovation
ZB MED - Informationszentrum Lebenswissenschaften

bernd.mueller@xxxxxxxx
Telefon: +49 (0) 221 478 7191

Gleueler Str. 60
50931 Köln

________________________________________
Von: Felix Lohmeier <felix.lohmeier@xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>
Gesendet: Freitag, 27. Januar 2017 12:24
An: inetbib@xxxxxxxxxx
Cc: Müller, Bernd
Betreff: [Spam] Re: [InetBib] Wissenschaftliche Ver�ffentlichung zu LIVIVO

Lieber Herr Müller,

danke für den Hinweis auf Ihren Artikel zu LIVIVO 
(https://dx.doi.org/10.1007/s13222-016-0245-2). Die technische Konzeption finde 
ich spannend, insbesondere den Teil zur Metadaten-Aggregation, den Sie "ZB MED 
Knowledge Environment" nennen. Leider finde ich aber im Netz keinen Quellcode 
und keine genaueren technischen Spezifikationen. Auch dem jüngsten Artikel von 
Ihrem Kollegen Herrn Poley (https://dx.doi.org/10.3205/mbi000376) sind keine 
Details zu entnehmen. Gibt es dazu mehr Informationen? Planen Sie, die Software 
unter einer Open-Source-Lizenz freizugeben?

Beste Grüße,
Felix Lohmeier


--
+494033484080
+491796605650
http://felixlohmeier.de